Przyczyny pojawienia się cyjanobakterii są różne, część nie jest znana. Czasem wykorzystują moment zaburzonej równowagi biologicznej, zbyt dużej ilości fosforanów, czasem wpływ ma również zbyt mocna filtracja przy pewnych rodzajach podłoża, bywa jednak i tak, że pojawiają się w akwariach, których parametry są Ok, gdy nitrat i fosforany nie są mierzalne.
Przy dobrych parametrach wody, niemierzalnym nitracie i fosforanach oraz dużej ilości roślin szybkorosących pomóc może dodatkowe podawanie nitratu i fosforanów. Takie działanie przy braku niedoborów skutkuje zielono-niebieską plagą. W pozostałych przypadkach pomaga zaciemnienie i intensywne podmiany wody.